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Spark numpyマトリックスからのデータフレームの作成

pySpark(Spark 2)を使用するのは初めてで、Logitモデル用のおもちゃのデータフレームを作成しようとしています。私は tutorial を正常に実行し、自分のデータをそれに渡したいと思います。

私はこれを試しました:

%pyspark
import numpy as np
from pyspark.ml.linalg import Vectors, VectorUDT
from pyspark.mllib.regression import LabeledPoint

df = np.concatenate([np.random.randint(0,2, size=(1000)), np.random.randn(1000), 3*np.random.randn(1000)+2, 6*np.random.randn(1000)-2]).reshape(1000,-1)
df = map(lambda x: LabeledPoint(x[0], Vectors.dense(x[1:])), df)

mydf = spark.createDataFrame(df,["label", "features"])

しかし私は取り除くことができません:

TypeError: Cannot convert type <class 'pyspark.ml.linalg.DenseVector'> into Vector

私はベクターにMLライブラリーを使用していて、入力はdouble配列なので、キャッチは何ですか? documentation に従って問題ないはずです。

どうもありがとう。

13
Jan Sila

MLとMLlibの機能が混在しているが、これらは必ずしも互換性がない。 spark-mlを使用する場合、LabeledPointは必要ありません。

sc.version
# u'2.1.1'

import numpy as np
from pyspark.ml.linalg import Vectors

df = np.concatenate([np.random.randint(0,2, size=(1000)), np.random.randn(1000), 3*np.random.randn(1000)+2, 6*np.random.randn(1000)-2]).reshape(1000,-1)
dff = map(lambda x: (int(x[0]), Vectors.dense(x[1:])), df)

mydf = spark.createDataFrame(dff,schema=["label", "features"])

mydf.show(5)
# +-----+-------------+ 
# |label|     features| 
# +-----+-------------+ 
# |    1|[0.0,0.0,0.0]| 
# |    0|[0.0,1.0,1.0]| 
# |    0|[0.0,1.0,0.0]| 
# |    1|[0.0,0.0,1.0]| 
# |    0|[0.0,1.0,0.0]|
# +-----+-------------+

PS:Spark 2.0以降、spark.mllibパッケージのRDDベースのAPIはメンテナンスモードになりました。 Sparkの主要な機械学習APIは、spark.mlパッケージのDataFrameベースのAPIになりました。 [ref。]

5
desertnaut

NumpyからPandas= Sparkへ:

spark.createDataFrame(pd.DataFrame(np.random.Rand(4,4),columns=list('abcd'))).show()

出力+-------------------+-------------------+------------------+-------------------+ | a| b| c| d| +-------------------+-------------------+------------------+-------------------+ | 0.8026427193838694|0.16867056812634307|0.2284873209015007|0.17141853164400833| | 0.2559088794287595| 0.3896957084615589|0.3806810025185623| 0.9362280141470332| |0.41313827425060257| 0.8087580640179158|0.5547653674054028| 0.5386190454838264| | 0.2948395900484454| 0.4085807623354264|0.6814694724946697|0.32031773805256325| +-------------------+-------------------+------------------+-------------------+

7
Jeff Hernandez

問題は簡単に解決できます。 ml AP​​Iとmllib AP​​Iを同時に使用しています。 1つに固執する。そうしないと、このエラーが発生します。

これは、mllibAPIのソリューションです。

import numpy as np
from pyspark.mllib.linalg import Vectors, VectorUDT
from pyspark.mllib.regression import LabeledPoint

df = np.concatenate([np.random.randint(0,2, size=(1000)), np.random.randn(1000), 3*np.random.randn(1000)+2, 6*np.random.randn(1000)-2]).reshape(1000,-1)
df = map(lambda x: LabeledPoint(x[0], Vectors.dense(x[1:])), df)

mydf = spark.createDataFrame(df,["label", "features"])

ml AP​​Iの場合、もうLabeledPointは必要ありません。これが です。 ml AP​​Iはまもなく廃止されるため、mllib AP​​Iの使用をお勧めします。

2
Dat Tran